بسیاری از سازمان ها به منظور بقا در محیط رقابت جهانی برای مدیریت پروژه های خود به سوی انتخاب بهترین سبد پروژه، گرایش پیدا کرده اند. سبد پروژه از میان پروژه های موجود که منابع کمیاب سازمان را مصرف می کنند، انتخاب می شود. به جهت دست یابی به این هدف، سازمان ها باید عدم قطعیت موجود در پروژه ها را نیز بررسی کنند. در حقیقت با استفاده از یک تکنیک ارزشیابی مناسب که انعطاف پذیری سرمایه گذاری را نیز در نظر می گیرد، در کنار یک چارچوپ بهینه سازی به این مهم دست یابند. در این پژوهش مساله انتخاب پروژه تحت عدم قطعیت، براساس رویکرد بهینه سازی استوار مدل سازی شده است. در مرحله ی اول، یک مدل جامع ریاضی که معرف ارزشیابی اختیار مرکب می باشد، به جهت رفع نقص رویکرد های سنتی برای محاسبه ارزش پروژه های چند مرحله ای ارائه می شود. سپس یک مدل انتخاب پروژه براساس بهینه سازی استوار توسعه داده می شود، که برای حل مسائل تحت عدم قطعیت، کارا است. در نهایت با فرض محدودیت بودجه سازمان مدل فوق، ارزش اختیار مرکب پروژه ها را بیشینه می سازد و براساس الگوریتم بهینه سازی استوار ترکیبی حل می گردد. کارایی رویکرد پیشنهادی توسط یک مثال جامع نشان داده خواهد شد.